В СПбГУ началась конференция по биоинформатике
В Санкт-Петербургском университете проходит Международная научная конференция «Биоинформатика: от алгоритма к применению».
Первые три дня ведущие мировые ученые, занимающиеся расшифровкой генетического кода, посвятят обсуждению последних разработок в этой области, а 4 и 5 августа молодые специалисты смогут научиться работать с новыми программными продуктами, среди которых — обновленная версия компьютерной программы Spades, разработанной учеными СПбГУ.
«Биоинформатика — прикладная наука, которая не может существовать без четко сформулированных задач. Поэтому нам необходимо знать, какие именно инструменты сейчас нужны биологам, врачам, генетикам. Конференция собрала вместе разработчиков программных продуктов и ученых, которые являются основными потребителями данных программ, чтобы упростить взаимодействие между двумя этими группами», — подчеркнула Алла Лапидус, заместитель директора Центра алгоритмической биотехнологии, который является частью Института трансляционной биомедицины СПбГУ.
Алла Львовна рассказала собравшимся о работе центра, который собрал вместе молодых и талантливых ученых для решения самых разнообразных задач современной биологии, в том числе для восстановления нуклеотидной последовательности генома.
«Одной из главных разработок центра является геномный сборщик St. Petersburg Assembler — один из самых узнаваемых российских продуктов в мире биоинформатики. Уже пять лет его используют ученые всего мира, тысячи специалистов в геномике работают со Spades, который создали в России, в Петербурге», — сообщила профессор Алла Лапидус.
>2000
раз процитирована cтатья, в которой был описан ассемблер.
Уникальный продукт алгоритмисты Санкт-Петербургского государственного университета разработали под руководством Павла Певзнера — ученого с мировым именем, на днях получившего престижную награду Международного общества вычислительной биологии. Именно выступление Павла Аркадьевича, посвященное проблеме изобретения новых антибиотиков, открыло научную программу конференции.
«Наш ассемблер оказался очень актуален при изучении антибиотиков. Это очень важная тема, ведь — как сказал недавно директор Центра контроля болезней США — человечество уперлось в конец дороги: все больше смертей происходит от болезней, которые устойчивы к антибиотикам, и если сейчас не будет совершен резкий скачок в изобретении новых антибиотиков, то мы войдем в смертельный виток», — отметил Павел Певзнер.
Участники конференции смогут не только узнать обо всех возможностях последних версий Spades от самих разработчиков, но и научиться работать с уникальным программным обеспечением в рамках практической школы. С 4 по 5 августа у молодых специалистов будет возможность обучиться основным принципам работы на платформе метода секвенирования нового поколения для расшифровки генетической информации с помощью петербургского ассемблера.