В СПбГУ проходит вторая международная конференция по биоинформатике

В Санкт-Петербургском университете началась вторая международная конференция «Биоинформатика: от алгоритмов к применению» (BiATA 2018).

Второй год подряд СПбГУ становится площадкой для встречи разработчиков программных продуктов для анализа современных биологических данных и ученых — поставщиков этих первичных данных со всего мира. «Опыт прошлогодней конференции показывает, что подобные камерные научные мероприятия помогают "математически" настроенным людям понять, какие инструменты сейчас нужны исследователям в области life science, а биологам найти понимающих помощников в сложном деле анализа огромных объемов данных. Так, благодаря BiATA 2017 завязались новые контакты, которые впоследствии вылились в новые проекты», — подчеркнула профессор СПбГУ Алла Лапидус, председатель программного комитета конференции, заместитель директора Центра алгоритмической биотехнологии Института трансляционной биомедицины Санкт-Петербургского государственного университета.

Тематика докладов конференции обширна: от изучения микроорганизмов кишечника и поиска новых видов вирусов до редактирования человеческого генома.

Научную программу конференции открыл доклад выдающегося микробиолога, профессора Калифорнийского университета (Сан-Диего, США) Роба Найта, который одним из первых стал изучать микробы, обитающие в организме человека и оказывающие значительное влияние на его здоровье. По последним оценкам, человеческий организм состоит примерно из 30 трлн клеток, но помимо них в теле человека присутствует коло 39 трлн различных микроорганизмов. Исследователи также сравнили ДНК человека и содержащихся в его организме микробов. «Оказалось, что человеческих генов в нашем теле около 20 тысяч, в то время как микробных — до 20 миллионов. Поэтому, чтобы улучшить эффективность работы нашего тела, так важно изучать нашу микробиоту, которая составляет 99 % человеческого организма. Особенно с учетом того, что бактерии человека постоянно меняются в течение всей жизни от момента нашего рождения в зависимости от самых разнообразных факторов. В том числе условий внешней среды», — отметил Роб Найт.

Свое выступление в Санкт-Петербургском университете американский ученый посвятил именно взаимосвязи микробиомов окружающего мира и человеческого здоровья. Профессор Найт рассказал про масштабный проект «Микробиом человека», в рамках которого американские ученые исследуют микробиоты десятков тысяч жителей США и не только. Роб Найт уверен: в дальнейшем это поможет лучше понимать, как микробиом влияет на здоровье человека, и лечить различные заболевания.

С открытыми лекциями во второй день BiATA 2018 выступили Михаил Гельфанд (член Европейской академии, заместитель директора Института проблем передачи информации РАН), Тимофей Ермак (компания Biocad) и Евгений Кунин (ведущий научный сотрудник Национального центра биотехнологической информации, руководитель группы эволюционной геномики в Национальном институте здравоохранения США).

Как и в прошлом году, у участников конференции будет уникальная возможность научиться работе с передовыми программными инструментами. В последний день BiATA 2018, 19 июля, профессор Роб Найт вместе с коллегой из Университета Калифорнии в Сан-Диего Амандой Бирмингем проведет практический семинар о программном пакете QIIME — Quantitative Insights Into Microbial Ecology, предназначенном для микробиомного анализа и используемом исследователями проекта «Микробиом человека». Для получения новых навыков участникам семинара будет достаточно иметь при себе ноутбук, поскольку QIIME находится в открытом доступе и использовать его может ученый из любой точки Земли.