Современные методы протеомики и белковой химии. Практический курс
Планирование протеомных экспериментов, подготовка протеомных образцов к анализу методами электрофореза, хроматографии и масс-спектрометрии. Электрофореза белков в ПААГ, анализ пептидов методами скорострельной протеомики (основы), биоинформатическая и статистическая обработка протеомных данных.
Реализация программы на базе ресурсного центра «Развитие молекулярных и клеточных технологий» Научного парка СПбГУ, оснащенного современным специализированным оборудованием и специализированным программным обеспечением с сопровождением высококвалифицированными специалистами в данной области.
В результате обучения обучающиеся узнают основы протеомики и химии белка, теорию разделения белков и пептидов методами электрофореза в ПАА-гелях и методами хроматографии, теоретические основы масс-спектрометрии, научатся основам обработки данных ВЭЖХ-МС и статистической обработке протеомных данных.
Смогут самостоятельно планировать протеомные исследования, готовить буферы для выделения белка, выделять белки из сырых тканей образцов, измерять концентрацию белка в растворах, проводить пробоподготовку протеомных образцов к электрофорезу в ПАА-гелях. Познакомятся с обращённо-фазовой хроматографией и масс-спектрометрией, научатся проводить электрофорез в ПАА-гелях, окрашивать ПАА-гели, анализировать электрофореграммы, анализировать данные ВЭЖХ-МС с помощью нескольких видов ПО (например, PEAKS Xpro, FragPipe, Mascot), проводить статистический анализ протеомных данных.
- Введение. Обзор курса. Дисциплинарные рекомендации. Химия белка и протеомика — сравнительный обзор возможностей, задач и методов. Обзор методов работы с белками и пептидами
- Приготовление буферов для выделения белка, выделение белка из выбранного объекта, переосаждение белка ацетоном.
- Подходы к фракционированию сложных смесей белков и пептидов. Электрофорез. Хроматография.
- Измерение концентрации белка. Заливка ПАА-гелей для электрофореза второго направления.Подготовка образцов к электрофорезу первого направления (регидратация IPG-стрипов)
- Ограниченный протеолиз. Секвенирование белков и пептидов.
- Изофокусирование белка (электрофорез 1го направления). Электрофорез по Лэммли (электрофорез 2го направления). Визуализация DIGE-гелей с использование лазерного сканера, окрашивание гелей красителем кумасси. Трипсинолиз образцов для «gel-free»-протеомики.
- Основы масс-спектрометрии
- Вырезание дифференциальных пятен из гелей. Трипсинолиз белков в геле. Экстракция триптических пептидов из геля. Обессоливание триптических пептидов на фазе С18.
- Особенности масс-спектрометрии белков и пептидов. Основы анализа протеомных данных.
- Ознакомление с работой хроматографа и масс-спектрометра. Подготовка образцов к анализу методом ВЭЖХ-МС. Запуск ВЭЖХ-МС анализа.
- Анализ данных ВЭЖХ-МС в специализированном ПО.
- Сравнение результатов «gel-based» и «gel-free»-подходов.Статистический анализ протеомных данных.
- Итоговый зачет.
Занятия проводят высококвалифицированные специалисты Научного парка СПбГУ.
- Наши преподаватели — учёные с мировым именем, опытные педагоги, лауреаты престижных международных премий.
- Мы разработали более 800 дополнительных образовательных программ — от самых популярных до самых редких и уникальных.
- У нас вы сможете соприкоснуться с 300-летней традицией первого российского классического университета и стать её частью.
- СПбГУ — это особая культурная среда, сформировавшая множество известных российских учёных, политиков, предпринимателей и деятелей культуры.
- Пройдя обучение, вы получите удостоверение установленного образца СПбГУ, подтверждающее высокий уровень полученных знаний.
- Обучаясь у нас, вы получите доступ к уникальным ресурсам Университета: от обширной научной библиотеки до многочисленных музеев.
Для записи на программу свяжитесь с нами по телефону или заполните форму ниже — мы свяжемся с Вами в течение одного рабочего дня.
Перед обучением необходимо оформить договор и произвести оплату. По любым вопросам вы всегда можете обратиться по тел.: +7 (812) 328-96-96 или эл. почте: a.samarina@spbu.ru.