Микробы, обитающие на территории России, станут объектом междисциплинарных исследований
Микробы, обитающие в почвах, водных объектах, а также организмах человека и животных, станут объектами комплексного междисциплинарного изучения со стороны группы научных институтов и университетов России. Такая задача была поставлена в ходе совещания «Микробиом России», состоявшегося сегодня в Санкт-Петербургском государственном университете, передает корр. ТАСС.
«Мы единогласно одобрили основные положения меморандума, предусматривающего создание единой программы исследований по микробиому (расширенное понятие микрофлоры и совокупности не только микробов, но и микробных генов. — Прим. ТАСС) России. Документ будет доработан экспертным сообществом и подписан руководителями научных институтов и исследовательских университетов к концу сентября», — сказал корр. ТАСС академик РАН и. о. декана Биологического факультета СПбГУ Игорь Тихонович. Он был инициатором проведения совещания «Микробиом России» и его модератором.
В тексте меморандума сформулирована задача по созданию единой программы исследований по микробиому России, координации всех профильных исследований в России, привлечению к проекту научных обществ генетиков и селекционеров, биохимиков, физиологов, налаживанию взаимодействия с зарубежными коллегами, учету их опыта, обращению в научные фонды за грантовой поддержкой исследований.
В совещании приняли участие 50 ученых — биологов, медиков, почвоведов из более чем десятка исследовательских организаций.
Что планируется сделать
Ученые полагают, что нужно создать единую базу данных, в которой бы содержалась генетическая информация обо всем микробном сообществе, обитающем в пределах территории России. Планируется изучать микробы, обитающие в почвах, водных объектах, кишечнике человека и животных, в организмах растений и микротрещинах бетона и других техногенных конструкциях, нефтяных скважинах и вечной мерзлоте. В рамках проекта ученые намерены создать суперкомпьютерные мощности для хранения и анализа генетического материала, развить экспедиционную и аналитическую деятельность.
«Мы с коллегами подсчитали, что сейчас в России работает не более 7–8 центров биоинформатики мирового уровня, располагающих суперкомпьютерными мощностями, на базе которых можно хранить и анализировать информацию о микроорганизмах. Требуется на порядок больше. Такие центры нужны в каждом крупном университете страны. А в каждом центре должны работать 15–20 программистов, а также молекулярные биологи, математики, биохимики, микробиологи», — пояснил корр. ТАСС Николай Пименов, заместитель директора по научной работе Федерального исследовательского центра «Биотехнологии» РАН.
«Одна из главных проблем — дефицит высококвалифицированных кадров, — считает он. — Скорость поступления данных секвенирования геномов живых организмов примерно в десять раз превышает скорость обработки этой информации. Для преодоления этого отставания как раз и нужны суперкомпьютеры, высококвалифицированные кадры — аналитики, также масштабная экспедиционная работа по сбору проб в разных природных ландшафтах страны», — сказал Николай Пименов.
Зачем нам знать генетику микробов?
«Микробиом» — это проект мониторинга живых организмов, обитающих во всех средах. «Эти исследования будут иметь практические последствия во многих значимых областях жизни — в медицине (создание новых лекарств, в том числе для персонализированной медицины), в сельском хозяйстве, воспроизводстве биоресурсов моря (разработка способов повышения плодородия почв и повышение биопродуктивности водоемов), в области экологии (сохранение уязвимых экосистем), в коммунальном хозяйстве (очистка сточных вод)», — пояснил корр. ТАСС Николай Пименов.
«Если мы не сделаем эта работу сами, нам никто не поможет, а биопрепараты, созданные учеными Европы или Америки, не будут эффективны, так как они не соответствуют нашим условиям и нашей микробиоте», — пояснил эксперт.
«Мы в хорошем положении. Европа и Америка уже ведут такую работу, а мы можем на них посмотреть и решить, как нам лучше действовать», — сказал на совещании Константин Скрябин, академик РАН, научный руководитель Федерального исследовательского центра РАН «Фундаментальные основы биотехнологий: современные проблемы микробиома». Вложения, которые делаются в это научное направление в США, достигают 200 млн долларов в год, а вместе со смежными проектами и до 500 млн, отмечает Скрябин.
Как отметила в ходе мероприятия заместитель руководителя лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ Алла Лапидус, учеными изучено не более трех процентов микроорганизмов из тех, что населяют Землю.